发布者: 医学情报室
PubMed
网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
资源介绍:
PubMed 是一个提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要,并且免费搜寻的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的资源,像是生化学与细胞生物学。该搜寻引擎是由美国国立医学图书馆提供,作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。
PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据,3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。
PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址链接,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。
数据库
PubMed医学文献检索服务系统,其数据主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。数据类型:期刊论文、综述、以及与其它数据库链接。
MEDLINE收录1966年以来的包含医学、护理、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献1600万余条书目数据(2005年数据),记录的标记为[PubMed-indexed for MEDLINE]。这些数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊,近年数据涉及30多个语种,回溯至1966年的数据涉及40多个语种,90%左右为英文文献,70%~80%的文献有著者撰写的英文摘要。
In Process Citations 1996年8月开始,每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-in process]。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时,每星期转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。
OLDMEDLINE:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要,记录的标记为:[PubMed-OLDMEDLINEfor Pre1966]。
Publisher-Supplied Citations (Articles Not in MEDLINE or IN Process)是由出版商提供的电子文献,每条记录标有[PubMed – as supplied by publisher]。这些文献包括两种来源:MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到In Process Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINE UI。
服务项目
●Journal Database: 可通过输入期刊刊名、ISSN或Medline刊名缩写查询期刊的出版资讯。
●MeSH Database:点选此功能后,在检索栏位中输入欲查询的词汇,可浏览PubMed资料库中所使用控制词汇。
●Single Citation Matcher:使用栏位化的检索方式,找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。
●Batch Citation Matcher:以指令式的方式批次检索资料库中相关的文献,只要输入刊名、年代、卷期、起始页、作者名、关键词其中部分栏位资料即可。
●Clinical Queries: 临床病理资料,本功能提供临床病理资料之查询,并依Haynes RB等专家所制订的最佳化检索策略之机制,使用者可先行选择检索方向,如:治疗方式(Therapy)、诊断方式(Diagnosis)、病因(Etiology)、预后状况(Prognosis)其中的一类,并可选择预期之检索结果是较具相关性(sensitivity)或精确率(specificity)较高的。
●LinkOut:LinkOut为PubMed提供使用者连结外部网路资源之功能选项,连结内容包括国外图书馆馆藏目录、线上电子全文、书目资料库清单、消费者健康资讯、研究参考资料等资讯。如有外部资源的连结,使用者可在PubMed摘要书目中看到LinkOut此一选项。
●免费个人化检索服务—My NCBI:在MY NCBI服务页建立个人检索帐号/密码后,即可使用个人化检索服务,该服务提供储存/删除检索结果、My LinkOut设定及文献传递等个人化服务。
■检索方法
●主题检索:在PubMed主页的检索框中键入英文单词或短语(大写或小写均可), PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。例如:键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”,PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
●著者检索:当所要查询的是著作者时,在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为“著者姓 空格 名字首字母缩写”,例如smith ja,系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。
●刊名检索 在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。
●日期或日期范围检索:可以在检索框中键入日期或日期范围,系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08。也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。
●检索期刊子集(辑) 检索的格式为:检索词AND jsubseta(或jsubsetd,或jsubsetn),如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing。分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。
●检索带文摘的记录 检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE记录中没有文摘。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物 学数据,序列中心的数据等等。PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
■特点
●词汇自动转换功能(automatic term mapping)PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表达或索引,对检索词进行转换后再检索。
●MeSH转换表(MeSH Translation Table)包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。
●刊名转换表(Journal Tanslation Table)包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Nanme]”后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Eng1 J Med [JournalName]”后进行检索。
●短语表(Phraselist)该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS:Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance)Namd]。如果PubMed系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。
■第三方PubMed
GoPubMed
GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件.通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间.检索者可以很快了解检索到文献的概貌和该研究领域的研究态势,如论文作者的研究轨迹、论文的年度分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化关系网络图以及作者分布世界地图等等.
PubMed-cn
PubMed-cn为丁香园旗下网站,专业的医学文献数据库,其数据每天与美国的NCBI数据中心同步一次。用户在检索文献时,可以立即看到该文献影响因子;用户可以在期刊数据库查询影响因子变化趋势、投稿指南、投稿经验等相关的信息。并且PubMed-cn提供国家自然科学基金查询,分析各个地区中标率,热门学科,是申请NSFC的好帮手。