发布者：医学情报室 来源：中国科学报 2021-7-28
基因组图谱提供了个人染色体主要变异的总体视图，比如大的插入、删除或序列的180度翻转。其中一些结构变异与疾病的遗传易感性有关。例如，许多血癌与染色体重排有关，在这种情况下，一条染色体部分断裂，然后附着到另一条染色体上。
目前，这些染色体重组和其他结构变异的图谱来自大量的测试，但根据近日在线发表于《美国人类遗传学杂志》的两项研究，只需要一种被称为光学基因组映射的方法就可以实现这一切。这项技术使用荧光显微镜观察DNA分子结构，提供了基因组结构的总体图。在两项研究中，一张光学图谱就可以探测到与疾病相关的结构变异。
“我们证明了该技术可以准确检测到已知畸变。”论文资深作者、法国科钦研究所细胞遗传学家Laila El-Khattabi说，下一步是当不知道有畸变存在时，比较光学基因组图谱与现有工具的准确性。如果光学基因组图谱能与其他技术相抗衡，或者发现更复杂的畸变，那么它可能成为临床医生的首选检测手段。
与El-Khattabi合作的荷兰拉德堡德大学医学中心遗传学家Alexander Hoischen说，光学基因组图谱的吸引力之一是之前的技术需要专门培训，掌握相关专业知识。而准备和分析光学基因组图谱将更加自动化和客观。
其中一项研究是由Hoischen和El-Khattabi领导的，研究重点是人们与生俱来的“体质”结构变异，这些变异与发育或生殖障碍有关。研究小组使用光学基因组图谱对85名患者血液样本或培养细胞中的99种染色体变异进行检测。这些变异以前是通过核型或其他两种测试检测到的。在每个案例中，光学基因组图谱都发现了之前检测到的畸变。而此前使用其他技术进行的测试都只检测到这些变体的一个子集。
另一项由Hoischen领导的研究聚焦于与急性髓系白血病等血癌相关的染色体畸变。这通常会贯穿一个人的一生。在52个病例中，有50个病例的光学基因组图谱检测出与标准测试相同的变异。光学测图法还发现了其他检测方法没有发现的更复杂的染色体结构，尽管还需要进一步的研究将这些变异与血癌的具体表现联系起来，但这可能最终会为临床护理决策提供信息。
并未参与该研究的休斯敦MD安德森癌症中心病理学家Rashmi Kanagal-Shamanna表示，光学基因组绘图作为主要诊断技术的潜在方式可能推动如今的临床护理决策。然而，标准的核型分析方法目前已被广泛应用于血癌诊断方案中。因此，只有进一步验证光学基因组图谱的作用，才有可能用其取代当前的核型分析方法。
相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2021.05.012
https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2021.06.001
